Otto assume le sembianze del pilota e si reca al suo posto, all'appuntamento con l'imperatore, insieme a Capitan Futuro che si finge morto. Non appena l'imperatore entra nella stanza, Capitan Futuro gli salta addosso per immobilizzarlo, ma ben presto si accorge che si tratta solo di un ologramma, una proiezione visiva dell'imperatore. Questi, successivamente si dirige sull'astronave per giustiziare il pilota, reo di aver fallito la missione. Intanto Capitan Futuro e Otto entrano nella città di Jungletown e quest'ultimo, grazie alla sua capacità di trasformazione, si fa arruolare nell'esercito per scoprire i piani dell'imperatore. Qui scoprono i cittadini in preda al morbo del regresso, che dopo delle mostruose trasformazioni, diventano degli uomini primitivi privi dell'uso della ragione. Uno di essi aggredisce la bella Joan, ma la ragazza non è certo indifesa e con una mossa di karatè riesce ad immobilizzare l'ominide. Joan Landor è la collaboratrice del generale Quail (Capitan Futuro la incontra per la prima volta), il quale raduna in segreto le alte cariche del pianeta per parlare sul grave morbo che ha colpito la popolazione. Joan accompagna Capitan Futuro all'ospedale-prigione dove sono raccolti i malati e questi viene subito colpito dal volto della ragazza che le ricorda i lineamenti di sua madre.

Capitan Futuro incontra il comandante Ezzle Garnie, suo vecchio amico, che lo invita a recarsi con lui presso l'ospedale-prigione situato in un isola circondata da lava incandescente. Qui però è già arrivato l'imperatore che vuole liberare gli uomini scimmia, al fine di portare il caos su Megara. Capitan Futuro e Joan, all'interno dell'ospedale, vengono attaccati dagli uomini scimmia e Capitan Futuro si difende con la sua pistola laser. L'imperatore disattiva la cupola di protezione dell'isola e a causa della lava, si diffonde un grave incendio. Grazie all'intervento del robot Greg, la cupola viene aggiustata e gli uomini scimmia vengono nuovamente rinchiusi nelle celle. Intanto nelle strade di Jungletown regna una strana calma, il morbo del regresso sembra aver diminuito la sua infezione e sembra che siano spariti dalla circolazione tutti gli indigeni del pianeta.

L'imperatore dello Spazio li ha infatti radunati sul pianeta Noon, per prepararli ad un attacco contro la base terrestre su Megara. L'imperatore avvisa il generale Quail e Garn dell'imminente attacco e questi chiedono aiuto a Capitan Futuro in quanto la loro guarnigione è ridotta al minimo. L'unica operazione possibile è quella di catturare l'imperatore. Il piccolo Ken azzarda l'ipotesi che l'imperatore sia in realtà, Kenneth Lester, uno scienziato terrestre che andò su Megara per compiere degli studi sulla civiltà Megara. Sulla base di quell'intuizione si decide di andare sulla città antica dove il cyborg del professor Wright, scopre che un uomo ha lasciato un segnale che indica un punto lontano; la stessa direzione che prese Lester. Questa direzione passa attraverso delle cascate di lava, dietro la quale si nasconde una città sotterranea. Qui Capitan Futuro e Greg trovano lo scienziato Kenneth Lester privo di sensi, che una volta ripresosi racconta di aver trovato un apparecchio in grado di rendere il proprio fisico pressochè incorporeo. Dopo quella scoperta Lester, venne aggredito da un uomo con una maschera di ferro che gli sottrasse l'apparecchio. Presi dal racconto, non si accorgono che qualcuno ha chiuso la porta dall'esterno. Lester posside una copia dell'apparecchio che però funziona solo con i robot, pertanto viene incaricato Greg di smaterializzarsi e passare attraverso i muri per liberarli. Intanto l'imperatore dello Spazio ordina di attaccare i terrestri, ma Capitan Futuro e il suo equipaggio sono già a bordo del Comet e si dirigono verso Noon, forti del segreto sul punto debole dell'imperatore, rivalatogli da Kenneth.
Questa è solo una delle tante entusiamanti avventure di Capitan Futuro, in seguito lo vedremo affrontare la "guardia" del pianeta SurÙun, Koom il pianeta sacro, il mago del circo galattico, gli uomini alati, il cacciatore di Bable, la foresta dei funghi giganti e fare viaggi allucinanti attraverso altre dimensioni, nel tempo e fra universi sovrapposti.